Mühendislik Fakültesi Bilgisayar Mühendisliği Bölümü Bilgisayar Yazılımı Anabilim Dalı
Telefon (0484) 212-1111 / 3012-3458
Kurumsal E-Posta tiryakiv  siirt.edu.tr
E-Posta
Açıklama https://scholar.google.com.tr/citations?user=dRyMnLEAAAAJ&hl=tr
Güncelleme23.06.2022 16:43:35

Doç.Dr VOLKAN MÜJDAT TİRYAKİ

  • Görev
  • Dosyalar
  • Çalışmalar
Mühendislik Fakültesi Öğretim Üyesi

YÖK Akademik

ÖZGEÇMİŞ

 

1. Adı Soyadı              : Volkan Müjdat TİRYAKİ

2. Doğum Tarihi          : 1981

3. Unvanı                    : Yrd. Doç. Dr.

4.Öğrenim Durumu    : Doktora

 

 

Derece

 

Alan

 

Üniversite

 

 

 

Yıl

Lisans

Elektronik Mühendisliği

İstanbul Üniversitesi

2003

Y. Lisans

Endüstri Mühendisliği

İstanbul Üniversitesi

2006

Doktora

Elektrik ve Bilgisayar Mühendisliği

Michigan Eyalet Üniversitesi

2013

 

5. Akademik Unvanlar

 

Yardımcı Doçentlik Tarihi        : 2015

 

6. Yönetilen Yüksek Lisans ve Doktora Tezleri

6.1. Yüksek Lisans Tezleri

            1.  Radiation Characteristics of Parabolic Reflector Antennas

 

7. Yayınlar

7.1. Uluslararası hakemli dergilerde yayınlanan makaleler (SCI ve SCI-E)

                1.  Tiryaki VM, Ayres VM, Ahmed I, Shreiber DI. A novel quantitative volumetric spreading index definition and assessment of astrocyte spreading in vitro.  Cytometry A. 2017 Aug; 91(8):794-799. doi: 10.1002/cyto.a.23183.

2. Tiryaki Volkan Müjdat, Ayres Virginia M, Ahmed Ijaz, Shreiber David I (2015). Differentiation of reactive-like astrocytes cultured on nanofibrillar and comparative culture surfaces. Nanomedicine, 10(4), 529-545., Doi: 10.2217/nnm.14.33.

3. Tiryaki Volkan Müjdat, Usienemnfon Adia Nimuwa,Ayres Virginia M, Ahmed Ijaz, Shreiber David I (2015). Texture-based segmentation andnew cell shape index quantitative analysis of cell spreading in AFM images. Cytometry Part A, 87(12), 1090-1100., Doi: 10.1002/cyto.a.22739.

4. Tiryaki, Volkan Müjdat, Ayres Virginia M, Khan Adeel A, Ahmed I, Shreiber David I, and Meiners Sally. Nanofibrillar scaffolds induce preferential activation of Rho GTPases in cerebral cortical astrocytes, Int. J. Nanomedicine Vol. 07, pp. 3891-3905 (2012).

5. Tiryaki Volkan Müjdat, Khan Adeel A,Ayres Virginia M.AFM feature definition neural cells on nanofibrillar tissue scaffolds. Scanning Vol. 34, pp. 316-324 (2012).

 

7.2. Uluslararası diğer hakemli dergilerde yayınlanan makaleler

 

7.3. Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında basılan bildiriler

1.         Tiryaki, V.M., Adia-Nimuwa, U., Hartz, S.A., Xie, K., Ayres, V.M., Ahmed, I. and Shreiber, D.I. (2013). New Atomic Force Microscopy Based Astrocyte Cell Shape Index. MRS Online Proceedings Library, 1527, mrsf12-1527-uu05-08 doi:10.1557/opl.2013.417.

2.         Ayres, V.M., Xie, K., Tiryaki, V.M., Ahmed, I., Shreiber, D.I., Investigation of Nanophysical Properties of Aging Nanofibrillar Tissue Scaffolds TEM, SAED, Contact Angle and Raman Spectroscopies. In MRS Online Proceedings Library, Volume 1417 Biomaterials Tissue Regeneration, edited C Sorrell. Published Cambridge University Press, Cambridge UK (2012). DOI: 10.1557/opl.2012.747. ISSN: 1946-4274.

3.         Tiryaki, V.M., Ayres, V.M., Ahmed, I., Shreiber, D.I. Differences in Nanoscale Elasticity of Planar and Nanofibrillar Tissue Cultures. In MRS Online Proceedings Library, Volume 1417 Biomaterials Tissue Regeneration, edited C Sorrell. Published Cambridge University Press, Cambridge UK (2012).  DOI: 10.1557/opl.2012.746. ISSN: 1946-4274.

4.         Tiryaki, V.M.,Ayres, V.M., Khan, A.A., Flowers, D.A., Ahmed, I., Delgado-Rivera, R., Meiners, S. Investigation of Nanofibrillar Influence on Cell-Cell Interactions of Astrocytes Atomic Force Microscopies. In MRS Online Proceedings Library, Volume 1316E:  Nanofunctional Materials, Nanostructures, and Nanodevices Biomedical Applications II, edited L A Nagahara, R Sinclair, R Bashir, T Thundat, W Lin. Published Cambridge University Press, Cambridge, UK (2011). 1316-QQ09-16, DOI: 10.1557/opl.2011.434. ISSN: 1946-4274.

5.         Tiryaki, V.M., Ayres, V.M., Khan, A.A., Delgado-Rivera, R., Ahmed, I., Meiners, S. Quantitative Investigations of Nanoscale Elasticity of Nanofibrillar Matrices. In MRS Symposium Proceedings Series, Volume 1240E Polymer Nanofibers-Fundamental Studies and Emerging Applications, edited A. Tanioka. Published The Materials Research Society, Warrendale, PA (2010). DOI: 10.1557/PROC-1240-WW09-13. ISSN: 1946-4274.

 

7.4. Yazılan uluslararası kitaplar veya kitaplarda bölümler

 

7.5. Ulusal hakemli dergilerde yayınlanan makaleler

 

7.6. Ulusal bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında basılan bildiriler

 

7.7. Diğer yayınlar

 

8.Projeler

1. Nanoscale Cues Regenerative Neural Cell Systems, Araştırmacı, NSF.

 

9.İdari Görevler

            1. Siirt Üniversitesi Bilgisayar Mühendisliği Bölüm Başkanlığı, 2016-Devam ediyor.

 

10.Bilimsel ve Mesleki Kuruluşlara Üyelikler

            1.  Materials Research Society

            2.  IEEE

3. American Society Cell Biology

 

11.Ödüller

 

12.Son iki yılda verdiğiniz lisans ve lisansüstü düzeydeki dersler için aşağıdaki tabloyu doldurunuz.

 

Akademik

Yıl

Dönem

Dersin Adı

Haftalık Saati

Öğrenci Sayısı

Teorik

Uygulama

 

2016-2017

Güz

Sayısal Tasarım

 

4

0

50

Güz

Sayısal Tasarım Lab.

0

3

48

Güz

Elektronik Devreler

3

2

55

Güz

Yapay Sinir Ağları

3

0

24

Güz

Sayısal Görüntü İşleme Teknikleri

3

0

12

Güz

Stokastik Sistem Analizi

3

0

13

İlkbahar

Bilgisayar Mimarisi

 

3

2

40

2016-2017

İlkbahar

Programlama Dilleri

3

0

47

İlkbahar

Bitirme Tezi

2

4

6

İlkbahar

Yapay Zeka

3

0

25

 

2017-2018

Güz

Sayısal Tasarım

 

4

0

55

Güz

Sayısal Tasarım Lab.

 

0

3

38

Güz

Elektronik Devreler

3

2

51

Güz

Yapay Sinir Ağları

3

0

38

Güz

Sayısal Görüntü İşleme Teknikleri

3

0

2

Güz

Stokastik Sistem Analizi

3

0

1

 

Güncelleme : 15.05.2019 13:42:46
D1.1 (YDM-ISI) : Yurt Dışı (SCI-expanded, SSCI, AHCI kapsamındaki) Dergilerde Yayımlanan Yayınları
1. Tiryaki VM, Ayres VM, Ahmed I, Shreiber DI. Sub-micro scale cell segmentation using deep learning. Cytometry A. 2022 Jan 9. doi: 10.1002/cyto.a.24533.
2.Tiryaki VM, Ayres VM, Ahmed I, Shreiber DI. A novel quantitative volumetric spreading index definition and assessment of astrocyte spreading in vitro.  Cytometry A. 2017 Aug; 91(8):794-799. doi: 10.1002/cyto.a.23183.
3.Tiryaki, VM, Adia-Nimuwa, U, Ayres, VM,Ahmed, I, Shreiber, DI. Texture-based segmentation and a new cell shape indexfor quantitative analysis of cell spreading in AFM images. Cytometry: Part A,2015, 87(12): 1090-1100 (DOI: 10.1002/cyto.a.22739).
4.Tiryaki, VM, Ayres, VM, Ahmed, I,Shreiber, DI. Differentiation of reactive-like astrocytes cultured onnanofibrillar and comparative culture surfaces. Nanomedicine, 2015 10(4): 529–545(DOI: 10.2217/NNM.14.33).
5.Tiryaki, VM, Ayres, VM, Khan, AA, Ahmed,I, Shreiber, DI, and Meiners, S “Nanofibrillar scaffolds induce preferentialactivation of Rho GTPases in cerebral cortical astrocytes”, Int. J.Nanomedicine Vol. 07, pp. 3891-3905 (2012).
6.Tiryaki, VM, Khan, AA,Ayres, VM “AFM featuredefinition for neural cells on nanofibrillar tissue scaffolds”, Scanning Vol.34, pp. 316-324 (2012).
D1.3 (YDT) : Yurt Dışı Bildiriler Kitabında Yayımlanan Yayınları
1.   Tiryaki, V.M., Adia-Nimuwa, U., Hartz, S.A.,Xie, K., Ayres, V.M., Ahmed, I. and Shreiber, D.I. (2013). New Atomic ForceMicroscopy Based Astrocyte Cell Shape Index. MRS Online Proceedings Library,1527, mrsf12-1527-uu05-08 doi:10.1557/opl.2013.417.
2.   Ayres,V.M., Xie, K., Tiryaki, V.M., Ahmed,I., Shreiber, D.I., “Investigation of Nanophysical Properties of AgingNanofibrillar Tissue Scaffolds by TEM, SAED, Contact Angle and RamanSpectroscopies”. In MRS Online Proceedings Library, Volume 1417 Biomaterials for Tissue Regeneration,edited by C Sorrell. Published by Cambridge University Press, Cambridge UK(2012). DOI: 10.1557/opl.2012.747. ISSN: 1946-4274.
3.   Tiryaki, V.M., Ayres, V.M., Ahmed, I., Shreiber,D.I., “Differences in Nanoscale Elasticity of Planar and Nanofibrillar TissueCultures”. In MRS Online Proceedings Library, Volume 1417 Biomaterials for Tissue Regeneration, edited by C Sorrell.Published by Cambridge University Press, Cambridge UK (2012).  DOI: 10.1557/opl.2012.746. ISSN: 1946-4274.
4.   Tiryaki, V.M.,Ayres, V.M., Khan, A.A., Flowers,D.A., Ahmed, I., Delgado-Rivera, R., Meiners, S., “Investigation ofNanofibrillar Influence on Cell-Cell Interactions of Astrocytes by Atomic ForceMicroscopies”. In MRS Online Proceedings Library, Volume 1316E:  NanofunctionalMaterials, Nanostructures, and Nanodevices for Biomedical Applications II,edited by L A Nagahara, R Sinclair, R Bashir, T Thundat, W Lin. Published byCambridge University Press, Cambridge, UK (2011). 1316-QQ09-16, DOI:10.1557/opl.2011.434. ISSN: 1946-4274.
5.   Tiryaki, V.M., Ayres, V.M., Khan, A.A.,Delgado-Rivera, R., Ahmed, I., Meiners, S., “Quantitative Investigations ofNanoscale Elasticity of Nanofibrillar Matrices”. In MRS Symposium ProceedingsSeries, Volume 1240E PolymerNanofibers-Fundamental Studies and Emerging Applications, edited by A. Tanioka.Published by The Materials Research Society, Warrendale, PA (2010). DOI:10.1557/PROC-1240-WW09-13. ISSN: 1946-4274.
D1.5 (YİM) : Yurt İçi Dergi Yayınları
D1.6 (YİT) : Yurt İçi Bildiriler Kitabında Yayımlanan Yayınları
D3: Destek Proje Yürütücülüğü
1. Yürütücü, Derin öğrenme kullanılarak bilgisayar destekli meme kanseri teşhisi, Siirt Üniversitesi Bilimsel Araştırma Proje Koordinatörlüğü, 2021-Devam ediyor.
E. AKADEMİK VE İDARİ GÖREVLERİ – TARİHLERİ
Akademik: Yardımcı Doçent Doktor. (2015)
İdari: Bilgisayar Mühendisliği Bölüm Başkanı. (2016)
G. EKLENMESİ DÜŞÜNÜLEN DİĞER HUSUSLAR:
Ulusal hakemli dergilerde yayımlanan makaleler
1. Tiryaki, V.M. Mamografi görüntülerindeki anormalliklerin yerel ikili örüntü ve varyantları kullanılarak sınıflandırılması. BEÜ Fen Bilimleri Dergisi 9 (1), 297-305, 2020.
Yayınlar
A. SCI ve SCI-E yayınlar
1.Tiryaki VM, Ayres VM, Ahmed I, Shreiber DI. Sub-micro scale cell segmentation using deep learning. Cytometry A. 2022 Jan 9. doi: 10.1002/cyto.a.24533. 
2.Tiryaki VM, Ayres VM, Ahmed I, Shreiber DI. A novel quantitative volumetric spreading index definition and assessment of astrocyte spreading in vitro.  Cytometry A. 2017 Aug; 91(8):794-799. doi: 10.1002/cyto.a.23183.
3.Tiryaki, VM, Adia-Nimuwa, U, Ayres, VM,Ahmed, I, Shreiber, DI. Texture-based segmentation and a new cell shape indexfor quantitative analysis of cell spreading in AFM images. Cytometry: Part A,2015, 87(12): 1090-1100 (DOI: 10.1002/cyto.a.22739).
4.Tiryaki, VM, Ayres, VM, Ahmed, I,Shreiber, DI. Differentiation of reactive-like astrocytes cultured onnanofibrillar and comparative culture surfaces. Nanomedicine, 2015 10(4): 529–545(DOI: 10.2217/NNM.14.33).
5.Tiryaki, VM, Ayres, VM, Khan, AA, Ahmed,I, Shreiber, DI, and Meiners, S “Nanofibrillar scaffolds induce preferentialactivation of Rho GTPases in cerebral cortical astrocytes”, Int. J.Nanomedicine Vol. 07, pp. 3891-3905 (2012).
6.Tiryaki, VM, Khan, AA,Ayres, VM “AFM featuredefinition for neural cells on nanofibrillar tissue scaffolds”, Scanning Vol.34, pp. 316-324 (2012).


B. Tam Metin Yayınlanmış Bildiriler

1.   Tiryaki, V.M., Adia-Nimuwa, U., Hartz, S.A.,Xie, K., Ayres, V.M., Ahmed, I. and Shreiber, D.I. (2013). New Atomic ForceMicroscopy Based Astrocyte Cell Shape Index. MRS Online Proceedings Library,1527, mrsf12-1527-uu05-08 doi:10.1557/opl.2013.417.
2.   Ayres,V.M., Xie, K., Tiryaki, V.M., Ahmed,I., Shreiber, D.I., “Investigation of Nanophysical Properties of AgingNanofibrillar Tissue Scaffolds by TEM, SAED, Contact Angle and RamanSpectroscopies”. In MRS Online Proceedings Library, Volume 1417 Biomaterials for Tissue Regeneration,edited by C Sorrell. Published by Cambridge University Press, Cambridge UK(2012). DOI: 10.1557/opl.2012.747. ISSN: 1946-4274.
3.   Tiryaki, V.M., Ayres, V.M., Ahmed, I., Shreiber,D.I., “Differences in Nanoscale Elasticity of Planar and Nanofibrillar TissueCultures”. In MRS Online Proceedings Library, Volume 1417 Biomaterials for Tissue Regeneration, edited by C Sorrell.Published by Cambridge University Press, Cambridge UK (2012).  DOI: 10.1557/opl.2012.746. ISSN: 1946-4274.
4.   Tiryaki, V.M.,Ayres, V.M., Khan, A.A., Flowers,D.A., Ahmed, I., Delgado-Rivera, R., Meiners, S., “Investigation ofNanofibrillar Influence on Cell-Cell Interactions of Astrocytes by Atomic ForceMicroscopies”. In MRS Online Proceedings Library, Volume 1316E:  NanofunctionalMaterials, Nanostructures, and Nanodevices for Biomedical Applications II,edited by L A Nagahara, R Sinclair, R Bashir, T Thundat, W Lin. Published byCambridge University Press, Cambridge, UK (2011). 1316-QQ09-16, DOI:10.1557/opl.2011.434. ISSN: 1946-4274.
5.   Tiryaki, V.M., Ayres, V.M., Khan, A.A.,Delgado-Rivera, R., Ahmed, I., Meiners, S., “Quantitative Investigations ofNanoscale Elasticity of Nanofibrillar Matrices”. In MRS Symposium ProceedingsSeries, Volume 1240E PolymerNanofibers-Fundamental Studies and Emerging Applications, edited by A. Tanioka.Published by The Materials Research Society, Warrendale, PA (2010). DOI:10.1557/PROC-1240-WW09-13. ISSN: 1946-4274.

C. SCI-SCI-E dışında uluslararası hakemli dergilerde yayınlanan makaleler
1. Mohammed H.A., Zeebaree S.R.M., Tiryaki V.M., Sadeeq M.A.M. Web-Based Land Registration Management System: Iraq/Duhok Case Study. Journal of Applied Science and Technology Trends, Vol. 02, No. 04, pp. 113 –119 (2021).
2. Bargarai F.A.M., Abdulazeez A.M., Tiryaki V.M., Zeebaree DQ. Management of Wireless Communication Systems Using Artificial Intelligence-Based Software Defined Radio, International Journal of Interactive Mobile Technologies, vol. 14 No. 13 (2020). 

D. Ulusal hakemli dergilerde yayınlanan makaleler
1. Tiryaki, V.M. Mamografi görüntülerindeki anormalliklerin yerel ikili örüntü ve varyantları kullanılarak sınıflandırılması. BEÜ Fen Bilimleri Dergisi 9 (1), 297-305, 2020.